<h3></h3><h5>効率的な解析と発見のための高度で直感的なマルチオミクスデータ可視化システム</h5>Dr.TomはmRNA、miRNA、lncRNAなどを含むあらゆるタイプのRNAデータの解析、可視化および解釈を便利に行うためのWebベースのソリューションです。シングルセルRNA-SeqデータおよびWGBSデータもDr.Tomにより解釈することができます。 BGIの専門科学者とバイオインフォマティシャンチームにより設計され、何千もの研究プロジェクトで集合的な経験を有するDr.Tomは、差次的発現やパスウェイ解析研究の時間を節約するために特別に設計された直感的でインタラクティブなデータ可視化ツールを幅広く提供しています。 さらに、強力な解析ツールと高度なアルゴリズムにより、データをマイニングし、標準的なRNA分析サービスを超える新しい洞察と価値を得ることができます。 世界複数のトップクラスのデータベースからのデータがDr.Tomのシステムに統合されているため、ユーザーはすべての結果と所見を参照し、クロスチェックすることができます。 Dr.Tomはすでに何万名の科学者や研究者からの信頼を得ており、価値のある重要なツールであることが示されています。Dr.Tomの詳細については、お気軽にお問合せください。 <h3><a target="_blank" href="https://biosys.bgi.com/#/report/login" id="gzqor">Dr.Tomシステムにログイン</a></h3> <video src="https://cdn.it.bgi.com/source/c1f466f3-3436-4d15-a1cc-548cf4542871_x264.mp4#t=0.1" controls="controls" style="max-width:100%"></video>

Dr.Tomの紹介

発現解析 Dr.Tomの詳細かつインタラクティブなヒートマップ機能を使用し、共通に制御されている遺伝子をすばやく特定することができます。シンプルなポイント＆クリック操作で、データを選択して処理し、さまざまなパスウェイの下にクラスターを表示できます。 <img src="https://cdn.it.bgi.com/source/image285.png" contenteditable="false" style="color: rgba(0, 0, 0, 0.85); font-size: 14px; max-width: 100%;"/>遺伝子セットエンリッチメント解析 Dr.Tomは、無料およびライセンスされたKEGGデータベースにアクセスし、ユーザーが多くの機能ゲノミクス技術とバイオインフォマティクス解析アプローチにより生成された遺伝子の大規模なリストから、統計的に有意な傾向を便利かつ迅速に特定することができます。 <img src="https://cdn.it.bgi.com/source/image852.png" contenteditable="false" style="color: rgba(0, 0, 0, 0.85); font-size: 14px; max-width: 100%;"/>複数のデータベースにわたるオントロジー情報の参照 Dr.Tomは、TCGA、NCBIなどを含む複数のデータベースを参照し、関連分析を行うことができます。これにより、ユーザーはアノテーション、シーケンス、発現レベル、および関連する公開論文のリストなど、目的の遺伝子の包括的なオントロジー情報を迅速かつ便利参照することが可能になります。 <img src="https://cdn.it.bgi.com/source/images-33.png" style="max-width:100%;" contenteditable="false"/>カスタムデータセット グラフ化や可視化のためのツールボックスを使用して、お客様の遺伝子発現データをアップロードし、エンリッチメント、クラスタリング、マルチオミクス関連解析のための独自の遺伝子アノテーションデータベースを構築することが可能です。<img src="https://cdn.it.bgi.com/source/image566.png" contenteditable="false" style="color: rgba(0, 0, 0, 0.85); font-size: 14px; max-width: 100%;"/>

コア機能

<h3> Dr.Tomを紹介するウェビナーに登録してオンデマンドで視聴し、システムのライブデモンストレーションをご覧ください。 <a target="_blank" href="https://www.bgi.com/global/resources/bgi-webinars-on-demand"></a><a target="_blank" href="https://www.bgi.com/global/resources/webinars/register?type=14">こちら</a>から登録すると、すばやくアクセスできます。 または、以下のユーザー事例をお読みください。 </h3>研究者らは、混合型白血病（MLL）の遺伝子組換えの相乗的治療のための阻害剤であるチダミドとMI-3（以下、CとM）と予後不良のメカニズムを研究したいと考えました。彼らは複数のDr.Tom分析機能を利用して、論文の鍵となるいくつかの疑問の答えを導き出すことに成功しました。このうちのいくつかとその回答を以下に示します。 <img alt="" src="https://www.bgi.com/wp-content/uploads/sites/2/2020/03/User-example-0.-png-300x142.png" width="50%"/> 1.研究者たちは、処理後の変化のパスウェイが何であるかを知りたいと考えました。KEGGエンリッチメント解析は、CとMを組み合わせた場合、最も重要なパスウェイは細胞周期、DNA複製、および修復パスウェイであることを示しました。 &nbsp; <img alt="" src="https://www.bgi.com/wp-content/uploads/sites/2/2020/03/User-example-1.-png-300x110.png" width="50%"/> 2.研究者らは、どの治療効果がより著しく、上記のパスウェイの変化を引き起こすかを知りたいと考えました。GSEA分析はさらに、これらの変化の大部分がMではなくCに由来することを示しました（図2BはCによる処理）。 &nbsp; <img alt="" src="https://www.bgi.com/wp-content/uploads/sites/2/2020/03/User-example-2.-png-300x104.png" width="50%"/> &nbsp; 3.研究者らは、各治療下で発現差のある遺伝子の共通部分は何であるかを知りたいと考えました。異なる治療下での識別遺伝子のベン図では、3つの治療全ての下で635の遺伝子が発現しました（図3C）。彼らはまた、これらの遺伝子が治療全体で一貫して上向き・下向きに調節されているのかを知りたいと考えました。グラフの中央をクリックすると遺伝子セットが表示され、ヒートマップが表示されます。59の遺伝子が異なる傾向を示しました（図3Dのボックスに表示）。M治療は下向きに調節され、C治療またはM+C治療は上向きに調節されました。研究者らはその後、上記のように異なる傾向の遺伝子をスクリーニングしたいと考えました。マップ上のボックスを選択することにより、関連する遺伝子セットが表示され、ヒートマップが生成されます。ヒートマップ（図3E）は、ポイント2の結果を裏付けています。 <img alt="" src="https://www.bgi.com/wp-content/uploads/sites/2/2020/03/User-example-3.-png-300x123.png" width="50%"/> 4.研究者らは、前のステップで示した遺伝子の機能が何であるかを知りたいと考えました。GOおよびKEGG解析（図4D、E）により、これらの遺伝子が重要な生存シグナルパスウェイ、すなわち炎症反応に必要なサイトカインパスウェイに関与していることを発見しました。 &nbsp; <img alt="" src="https://www.bgi.com/wp-content/uploads/sites/2/2020/03/User-example-4.-png-300x97.png" width="50%"/> 5.研究者らは、他の重要な遺伝子のスクリーニングを継続したいと考えました。彼らは発現の異なるグループを選択し、フィルタリング条件を調整して、ヒートマップを生成しました（図5A）。 &nbsp; <img alt="" src="https://www.bgi.com/wp-content/uploads/sites/2/2020/03/User-example-5.-png-300x188.png" width="50%"/> &nbsp;

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