当社は、腫瘍の不均一性に関する研究のためのFFPEプロテオミクス分野における豊富な経験を持ち合わせています。FFPE切片1枚など、初期サンプル量が少なくても処理が可能です。

サービス概要

FFPEサンプルとは、FFPE法で処理された組織サンプルのことで、室温で数十年間安定して保存でき、病理組織学的解析のゴールドスタンダードとされています1。



FFPEプロテオミクス

適切なライブラリー構築サンプルがある場合のFFPEサンプル解析
FFPEサンプル---脱脂と補水---脱クロスリンク---タンパク質---酵素分解---LC-MS/MS　DIA解析---データ解析

ワークフロー

適切なライブラリー構築サンプルがない場合のFFPEサンプル解析
FFPEサンプル---脱脂と補水---脱クロスリンク---タンパク質---酵素分解---LC-MS/MS　DIA解析---データ解析

参考資料 [1] Marchione D M, et al., HYPERsol: High-Quality Data from Archival FFPE Tissue for Clinical Proteomics. J Proteome Res, 2020 Feb 7; 19(2): 973–983.

発注方法

<ul><li>酵素加水分解のQCはLC-MSにより厳密に管理されます。</li><li>HPLC技術とサンプル分画を用いてDDAスペクトルライブラリを作成</li></ul>

サンプル調製とサービス

<ul><li>概要にはすべてのメソッドとデータ分析が含まれます。</li><li>レポートはExcelまたはPDF形式でご提供、ご要望に応じてRAWファイルの提供が可能</li></ul>

品質基準

<ul><li>お問い合わせ</li></ul>

納期

サンプル条件

<ul><li>MASCOTでデータ解析・検証を実施</li><li>タンパク質同定・定量リスト</li><li>示差タンパク質データ統計とボルケーノプロット</li><li>主成分分析（PCA）およびクラスター分析</li><li>タンパク質GO/COG/KOG/パスウェイアノテーション</li><li>示差タンパク質のGO/COG/KOG エンリッチメント解析</li><li>タンパク質間相互作用解析</li><li>タンパク質細胞内局在解析</li><li>時系列分析</li><li>再現性分析</li></ul>