BGIは精密医療研究を支えるマルチナショナルDIAプロテオミクス解析の定量的性能評価、標準化及び調和に参画しています。当社は複雑な生物学的マトリックスやその他の複雑な混合物中のタンパク質を正確に定量するプロセスを最適化するための、革新的なソリューションを開発しました。

サービス概要

サンプル調製---HPLC-UV分画---LC-MS/MSDDA解析---DDAライブラリ作成と更新---LC-MS/MS DIA解析---定量とバイオインフォマティクス。

ワークフロー

定量とバイオインフォマティクス

[1]. Wong, J. W. H., & Cagney, G. (2009). An Overview of Label-Free Quantitation Methods in Proteomics by Mass Spectrometry. Proteome Bioinformatics, 273–283.doi:10.1007/978-1-60761-444-9_18.
[2]. Searle BC, Pino LK, Egertson JD, Ting YS, Lawrence RT, MacLean BX, Villén J, MacCoss MJ. Chromatogram libraries improve peptide detection and quantification by data independent acquisition mass spectrometry. Nat Commun. 2018 Dec 3;9(1):5128. doi: 10.1038/s41467-018-07454-w.

参考資料

発注方法

<ul><li>酵素加水分解のQCはLC-MSにより厳密に管理されます。</li><li>HPLC技術とサンプル分画を用いてDDAスペクトルライブラリを作成</li><li>血液以外は2h/フラクション、ヒトの血液以外は2h/フラクション、ヒトの血液は1h/フラクション</li></ul>

サンプル調製とサービス

<ul><li>概要にはすべてのメソッドとデータ分析が含まれます。</li><li>レポートはExcelまたはPDF形式でご提供、ご要望に応じてRAWファイルの提供が可能</li></ul>

品質基準

<ul><li>お問い合わせ</li></ul>

納期

サンプル条件

<ul><li>MASCOTでデータ解析・検証を実施</li><li>タンパク質同定・定量リスト</li><li>示差タンパク質データ統計とボルケーノプロット</li><li>主成分分析（PCA）およびクラスター分析</li><li>タンパク質GO/COG/KOG/パスウェイアノテーション</li><li>示差タンパク質のGO/COG/KOG エンリッチメント解析</li><li>タンパク質間相互作用解析</li><li>タンパク質細胞内局在解析</li><li>時系列分析</li><li>再現性分析</li><li>定量プロテオミクス+リン酸化プロテオミクス相関解析</li></ul>

ラベルフリーDIA定量