トランスクリプトームシーケンス解析は特定の条件下において、生物サンプルの中のRNA の有無、量および構造を明らかにするために使用されます。マイクロアレイ解析のようなハイブリダイゼーションに基づくRNA 定量法に比べ、シーケンシングに基づくトランスクリプトーム検出はより広いダイナミックレンジで、低バックグラウンド、高精度かつ高再現性で遺伝子発現を定量することができます。さらに、トランスクリプトームシーケンス解析では既存のゲノム配列を必要とせず、マイクロアレイでは検出できない変異、スプライスバリアントおよび融合遺伝子の検出が可能です。

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