Shotgunライブラリー作製とシーケンシング

製品概要

Shotgunライブラリーとは、目的DNAを機械的剪断方法(mechanical shearing method)でランダムに断片化し、ベクターと連接して作製されるライブラリーのことを言います。Shotgunライブラリーの作製とシーケンシングには以下の種類があります。

  • ウィルス・ファージ・野生型のプラスミドなどの小型DNAのシーケンシング
  • BAC/Fosmidクローンのシーケンシング
  • 遺伝子スクリーニング
  • リファレンス配列のない長い断片(9Kb以上)のシーケンシング


ワークフロー

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技術パラメーター

1.サンプル要件

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※ライブラリー作製が困難と判断される場合がありますので、予備のサンプルの同梱を推奨しています。

2.推奨ライブラリーサイズ

2~3Kb ・4~6Kb・6~8Kb


データ解析

ライブラリーの容量、挿入断片のサイズ、ランダム性、Blast結果などを解析

大規模なシーケンシングアセンブリーを完成後、平均カバー率・低質量領域・スペシャル構造などの

アセンブリーを評価



納品物

ライブラリー作製プロジェクト:形質転換した細菌の菌液全てとライブラリー検査報告書

ライブラリー作製とシーケンシングプロジェクト:アセンブリー報告書


納期

ラブラリー作製:約30営業日

ライブラリー作製とシーケンシング:約60営業日


注意事項

1.ご依頼の内容により、サンプルの必要量が異なりますので、詳細はBGI JAPANまでお問合せください。
2.サンプルはドライアイスを同梱し、ヤマト運輸の着払い・クール便(冷凍タイプ)で発送してください。
3.翌日着予定(離島を除く)月曜~木曜に到着するよう発送してください。
4.お客様のサンプルを迅速に輸送するための事前準備(輸送会社・ドライアイス手配)が必要ですので、サンプルの発送日を、発送当日の午後5時までに必ずご連絡ください。
連絡方法:Fax:078−599−6109 & E-mail:bgijp-sample@genomics.cn (BGI JAPAN株式会社)
5.再度品質検査の結果によっては、再度サンプルのご提供をいただく場合がございます。
6.サンプルはライブラリー作製・納品後、破棄させていただきます。返送、保管についてはご相談下さい。